香港公司注册后在经营过程中主要涉及的税种是利得税，相当于内地公司每年需要缴纳的所得税，但香港公司不是每年都需要缴纳。这取决于香港公司的实际经营情况。
香港公司与大陆公司不同，香港公司不需要每月或每季度报税，只需要每年申报一次利得税就好了。利得税申报方式有很多种，根据香港公司的不同经营情况分为:
1.零申报：适用于尚未经营的香港公司。
2.正常做账审计报税：适用于正常经营的香港公司。
3.海外利得税豁免：适用于公司业务的发展和利润的获取都在香港境外的香港公司。需要注意的是，香港公司的做账审计工作需要由香港持牌会计师进行。因此，一般香港公司的审计税务工作都会交给专业代理公司处理。
除利得税外，香港公司还涉及薪俸税。
如果香港公司雇佣员工并发放工资，则需要申报薪俸税。但薪俸税每人每年都有免税额13.2万元。
此外，还涉及厘印税(印花税)，一般在香港公司股权变更时需要缴纳。
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